5ZAP

Atomic structure of the herpes simplex virus type 2 B-capsid

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This can be caused by an outdated browser, graphics card driver issue, or bad weather. Sometimes, just restarting the browser helps. Also, make sure hardware acceleration is enabled in your browser.

For a list of supported browsers, refer to http://caniuse.com/#feat=webgl.

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RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Electron Density
Click on a residue to display electron density, click background to reset.
Sequence of
     ​M​​A​​A​​P​​A​​R​​D​​P​​P​​G​11   ​Y​​R​​Y​​A​​A​​A​​M​​V​​P​​T​21   ​G​​S​​I​​L​​S​​T​​I​​E​​V​​A​31   ​S​​H​​R​​R​​L​​F​​D​​F​​F​​A​41   ​R​​V​​R​​S​​D​​E​​N​​S​​L​​Y​51   ​D​​V​​E​​F​​D​​A​​L​​L​​G​​S​61   ​Y​​C​​N​​T​​L​​S​​L​​V​​R​​F​71   ​L​​E​​L​​G​​L​​S​​V​​A​​C​​V​81   ​C​​T​​K​​F​​P​​E​​L​​A​​Y​​M​91   ​N​​E​​G​​R​​V​​Q​​F​​E​​V​​H​101  ​Q​​P​​L​​I​​A​​R​​D​​G​​P​​H​111  ​P​​V​​E​​Q​​P​​V​​H​​N​​Y​​M​121  ​T​​K​​V​​I​​D​​R​​R​​A​​L​​N​131  ​A​​A​​F​​S​​L​​A​​T​​E​​A​​I​141  ​A​​L​​L​​T​​G​​E​​A​​L​​D​​G​151  ​T​​G​​I​​S​​L​​H​​R​​Q​​L​​R​161  ​A​​I​​Q​​Q​​L​​A​​R​​N​​V​​Q​171  ​A​​V​​L​​G​​A​​F​​E​​R​​G​​T​181  ​A​​D​​Q​​M​​L​​H​​V​​L​​L​​E​191  ​K​​A​​P​​P​​L​​A​​L​​L​​L​​P​201  ​M​​Q​​R​​Y​​L​​D​​N​​G​​R​​L​211  ​A​​T​​R​​V​​A​​R​​A​​T​​L​​V​221  ​A​​E​​L​​K​​R​​S​​F​​C​​D​​T​231  ​S​​F​​F​​L​​G​​K​​A​​G​​H​​R​241  ​R​​E​​A​​I​​E​​A​​W​​L​​V​​D​251  ​L​​T​​T​​A​​T​​Q​​P​​S​​V​​A​261  ​V​​P​​R​​L​​T​​H​​A​​D​​T​​R​271  ​G​​R​​P​​V​​D​​G​​V​​L​​V​​T​281  ​T​​A​​A​​I​​K​​Q​​R​​L​​L​​Q​291  ​S​​F​​L​​K​​V​​E​​D​​T​​E​​A​301  ​D​​V​​P​​V​​T​​Y​​G​​E​​M​​V​311  ​L​​N​​G​​A​​N​​L​​V​​T​​A​​L​321  ​V​​M​​G​​K​​A​​V​​R​​S​​L​​D​331  ​D​​V​​G​​R​​H​​L​​L​​D​​M​​Q​341  ​E​​E​​Q​​L​​E​​A​​N​​R​​E​​T​351  ​L​​D​​E​​L​​E​​S​​A​​P​​Q​​T​361  ​T​​R​​V​​R​​A​​D​​L​​V​​A​​I​371  ​G​​D​​R​​L​​V​​F​​L​​E​​A​​L​381  ​E​​K​​R​​I​​Y​​A​​A​​T​​N​​V​391  ​P​​Y​​P​​L​​V​​G​​A​​M​​D​​L​401  ​T​​F​​V​​L​​P​​L​​G​​L​​F​​N​411  ​P​​A​​M​​E​​R​​F​​A​​A​​H​​A​421  ​G​​D​​L​​V​​P​​A​​P​​G​​H​​P​431  ​E​​P​​R​​A​​F​​P​​P​​R​​Q​​L​441  ​F​​F​​W​​G​​K​​D​​H​​Q​​V​​L​451  ​R​​L​​S​​M​​E​​N​​A​​V​​G​​T​461  ​V​​C​​H​​P​​S​​L​​M​​N​​I​​D​471  ​A​​A​​V​​G​​G​​V​​N​​H​​D​​P​481  ​V​​E​​A​​A​​N​​P​​Y​​G​​A​​Y​491  ​V​​A​​A​​P​​A​​G​​P​​G​​A​​D​501  ​M​​Q​​Q​​R​​F​​L​​N​​A​​W​​R​511  ​Q​​R​​L​​A​​H​​G​​R​​V​​R​​W​521  ​V​​A​​E​​C​​Q​​M​​T​​A​​E​​Q​531  ​F​​M​​Q​​P​​D​​N​​A​​N​​L​​A​541  ​L​​E​​L​​H​​P​​A​​F​​D​​F​​F​551  ​A​​G​​V​​A​​D​​V​​E​​L​​P​​G​561  ​G​​E​​V​​P​​P​​A​​G​​P​​G​​A​571  ​I​​Q​​A​​T​​W​​R​​V​​V​​N​​G​581  ​N​​L​​P​​L​​A​​L​​C​​P​​V​​A​591  ​F​​R​​D​​A​​R​​G​​L​​E​​L​​G​601  ​V​​G​​R​​H​​A​​M​​A​​P​​A​​T​611  ​I​​A​​A​​V​​R​​G​​A​​F​​E​​D​621  ​R​​S​​Y​​P​​A​​V​​F​​Y​​L​​L​631  ​Q​​A​​A​​I​​H​​G​​S​​E​​H​​V​641  ​F​​C​​A​​L​​A​​R​​L​​V​​T​​Q​651  ​C​​I​​T​​S​​Y​​W​​N​​N​​T​​R​661  ​C​​A​​A​​F​​V​​N​​D​​Y​​S​​L​671  ​V​​S​​Y​​I​​V​​T​​Y​​L​​G​​G​681  ​D​​L​​P​​E​​E​​C​​M​​A​​V​​Y​691  ​R​​D​​L​​V​​A​​H​​V​​E​​A​​L​701  ​A​​Q​​L​​V​​D​​D​​F​​T​​L​​P​711  ​G​​P​​E​​L​​G​​G​​Q​​A​​Q​​A​721  ​E​​L​​N​​H​​L​​M​​R​​D​​P​​A​731  ​L​​L​​P​​P​​L​​V​​W​​D​​C​​D​741  ​G​​L​​M​​R​​H​​A​​A​​L​​D​​R​751  ​H​​R​​D​​C​​R​​I​​D​​A​​G​​G​761  ​H​​E​​P​​V​​Y​​A​​A​​A​​C​​N​771  ​V​​A​​T​​A​​D​​F​​N​​R​​N​​D​781  ​G​​R​​L​​L​​H​​N​​T​​Q​​A​​R​791  ​A​​A​​D​​A​​A​​D​​D​​R​​P​​H​801  ​R​​P​​A​​D​​W​​T​​V​​H​​H​​K​811  ​I​​Y​​Y​​Y​​V​​L​​V​​P​​A​​F​821  ​S​​R​​G​​R​​C​​C​​T​​A​​G​​V​831  ​R​​F​​D​​R​​V​​Y​​A​​T​​L​​Q​841  ​N​​M​​V​​V​​P​​E​​I​​A​​P​​G​851  ​E​​E​​C​​P​​S​​D​​P​​V​​T​​D​861  ​P​​A​​H​​P​​L​​H​​P​​A​​N​​L​871  ​V​​A​​N​​T​​V​​N​​A​​M​​F​​H​881  ​N​​G​​R​​V​​V​​V​​D​​G​​P​​A​891  ​M​​L​​T​​L​​Q​​V​​L​​A​​H​​N​901  ​M​​A​​E​​R​​T​​T​​A​​L​​L​​C​911  ​S​​A​​A​​P​​D​​A​​G​​A​​N​​T​921  ​A​​S​​T​​A​​N​​M​​R​​I​​F​​D​931  ​G​​A​​L​​H​​A​​G​​V​​L​​L​​M​941  ​A​​P​​Q​​H​​L​​D​​H​​T​​I​​Q​951  ​N​​G​​E​​Y​​F​​Y​​V​​L​​P​​V​961  ​H​​A​​L​​F​​A​​G​​A​​D​​H​​V​971  ​A​​N​​A​​P​​N​​F​​P​​P​​A​​L​981  ​R​​D​​L​​A​​R​​H​​V​​P​​L​​V​991  ​P​​P​​A​​L​​G​​A​​N​​Y​​F​​S​1001 ​S​​I​​R​​Q​​P​​V​​V​​Q​​H​​A​1011 ​R​​E​​S​​A​​A​​G​​E​​N​​A​​L​1021 ​T​​Y​​A​​L​​M​​A​​G​​Y​​F​​K​1031 ​M​​S​​P​​V​​A​​L​​Y​​H​​Q​​L​1041 ​K​​T​​G​​L​​H​​P​​G​​F​​G​​F​1051 ​T​​V​​V​​R​​Q​​D​​R​​F​​V​​T​1061 ​E​​N​​V​​L​​F​​S​​E​​R​​A​​S​1071 ​E​​A​​Y​​F​​L​​G​​Q​​L​​Q​​V​1081 ​A​​R​​H​​E​​T​​G​​G​​G​​V​​N​1091 ​F​​T​​L​​T​​Q​​P​​R​​G​​N​​V​1101 ​D​​L​​G​​V​​G​​Y​​T​​A​​V​​A​1111 ​A​​T​​A​​T​​V​​R​​N​​P​​V​​T​1121 ​D​​M​​G​​N​​L​​P​​Q​​N​​F​​Y​1131 ​L​​G​​R​​G​​A​​P​​P​​L​​L​​D​1141 ​N​​A​​A​​A​​V​​Y​​L​​R​​N​​A​1151 ​V​​V​​A​​G​​N​​R​​L​​G​​P​​A​1161 ​Q​​P​​L​​P​​V​​F​​G​​C​​A​​Q​1171 ​V​​P​​R​​R​​A​​G​​M​​D​​H​​G​1181 ​Q​​D​​A​​V​​C​​E​​F​​I​​A​​T​1191 ​P​​V​​A​​T​​D​​I​​N​​Y​​F​​R​1201 ​R​​P​​C​​N​​P​​R​​G​​R​​A​​A​1211 ​G​​G​​V​​Y​​A​​G​​D​​K​​E​​G​1221 ​D​​V​​I​​A​​L​​M​​Y​​D​​H​​G​1231 ​Q​​S​​D​​P​​A​​R​​P​​F​​A​​A​1241 ​T​​A​​N​​P​​W​​A​​S​​Q​​R​​F​1251 ​S​​Y​​G​​D​​L​​L​​Y​​N​​G​​A​1261 ​Y​​H​​L​​N​​G​​A​​S​​P​​V​​L​1271 ​S​​P​​C​​F​​K​​F​​F​​T​​A​​A​1281 ​D​​I​​T​​A​​K​​H​​R​​C​​L​​E​1291 ​R​​L​​I​​V​​E​​T​​G​​S​​A​​V​1301 ​S​​T​​A​​T​​A​​A​​S​​D​​V​​Q​1311 ​F​​K​​R​​P​​P​​G​​C​​R​​E​​L​1321 ​V​​E​​D​​P​​C​​G​​L​​F​​Q​​E​1331 ​A​​Y​​P​​I​​T​​C​​A​​S​​D​​P​1341 ​A​​L​​L​​R​​S​​A​​R​​D​​G​​E​1351 ​A​​H​​A​​R​​E​​T​​H​​F​​T​​Q​1361 ​Y​​L​​I​​Y​​D​​A​​S​​P​​L​​K​1371 ​G​​L​​S​​L​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

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