AF_AFA2A935F1

Computed structure model of Histone-lysine N-methyltransferase PRDM16

Refer to the legend below to interpret the coloring by pLDDT confidence scores.

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RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Sequence of
1    ​M​​R​​S​​K​​A​​R​​A​​R​​K​​L​11   ​A​​K​​S​​D​​G​​D​​V​​V​​N​​N​21   ​M​​Y​​E​​P​​D​​P​​D​​L​​L​​A​31   ​G​​Q​​S​​A​​E​​E​​E​​T​​E​​D​41   ​G​​I​​L​​S​​P​​I​​P​​M​​G​​P​51   ​P​​S​​P​​F​​P​​T​​S​​E​​D​​F​61   ​T​​P​​K​​E​​G​​S​​P​​Y​​E​​A​71   ​P​​V​​Y​​I​​P​​E​​D​​I​​P​​I​81   ​P​​P​​D​​F​​E​​L​​R​​E​​S​​S​91   ​I​​P​​G​​A​​G​​L​​G​​I​​W​​A​101  ​K​​R​​K​​M​​E​​I​​G​​E​​R​​F​111  ​G​​P​​Y​​V​​V​​T​​P​​R​​A​​A​121  ​L​​K​​E​​A​​D​​F​​G​​W​​E​​M​131  ​L​​T​​D​​T​​E​​V​​S​​S​​Q​​E​141  ​S​​C​​I​​K​​K​​Q​​I​​S​​E​​D​151  ​L​​G​​S​​E​​K​​F​​C​​V​​D​​A​161  ​N​​Q​​A​​G​​S​​G​​S​​W​​L​​K​171  ​Y​​I​​R​​V​​A​​C​​S​​C​​D​​D​181  ​Q​​N​​L​​A​​M​​C​​Q​​I​​N​​E​191  ​Q​​I​​Y​​Y​​K​​V​​I​​K​​D​​I​201  ​E​​P​​G​​E​​E​​L​​L​​V​​H​​V​211  ​K​​E​​G​​A​​Y​​S​​L​​G​​V​​M​221  ​A​​P​​S​​L​​D​​E​​D​​P​​T​​F​231  ​R​​C​​D​​E​​C​​D​​E​​L​​F​​Q​241  ​C​​R​​L​​D​​L​​R​​R​​H​​K​​K​251  ​Y​​A​​C​​S​​S​​A​​G​​A​​Q​​L​261  ​Y​​E​​G​​L​​G​​E​​E​​L​​K​​P​271  ​E​​G​​L​​G​​V​​G​​S​​D​​G​​Q​281  ​A​​H​​E​​C​​K​​D​​C​​E​​R​​M​291  ​F​​P​​N​​K​​Y​​S​​L​​E​​Q​​H​301  ​M​​I​​V​​H​​T​​E​​E​​R​​E​​Y​311  ​K​​C​​D​​Q​​C​​P​​K​​A​​F​​N​321  ​W​​K​​S​​N​​L​​I​​R​​H​​Q​​M​331  ​S​​H​​D​​S​​G​​K​​R​​F​​E​​C​341  ​E​​N​​C​​V​​K​​V​​F​​T​​D​​P​351  ​S​​N​​L​​Q​​R​​H​​I​​R​​S​​Q​361  ​H​​V​​G​​A​​R​​A​​H​​A​​C​​P​371  ​D​​C​​G​​K​​T​​F​​A​​T​​S​​S​381  ​G​​L​​K​​Q​​H​​K​​H​​I​​H​​S​391  ​T​​V​​K​​P​​F​​I​​C​​E​​V​​C​401  ​H​​K​​S​​Y​​T​​Q​​F​​S​​N​​L​411  ​C​​R​​H​​K​​R​​M​​H​​A​​D​​C​421  ​R​​T​​Q​​I​​K​​C​​K​​D​​C​​G​431  ​Q​​M​​F​​S​​T​​T​​S​​S​​L​​N​441  ​K​​H​​R​​R​​F​​C​​E​​G​​K​​N​451  ​H​​Y​​T​​P​​G​​S​​I​​F​​T​​P​461  ​G​​L​​P​​L​​T​​P​​S​​P​​M​​M​471  ​D​​K​​T​​K​​P​​S​​P​​T​​L​​N​481  ​H​​G​​G​​L​​G​​F​​S​​E​​Y​​F​491  ​P​​S​​R​​P​​H​​P​​G​​S​​L​​P​501  ​F​​S​​A​​A​​P​​P​​A​​F​​P​​A​511  ​L​​T​​P​​G​​F​​P​​G​​I​​F​​P​521  ​P​​S​​L​​Y​​P​​R​​P​​P​​L​​L​531  ​P​​P​​T​​P​​L​​L​​K​​S​​P​​L​541  ​N​​H​​A​​Q​​D​​A​​K​​L​​P​​S​551  ​P​​L​​G​​N​​P​​A​​L​​P​​L​​V​561  ​S​​A​​V​​S​​N​​S​​S​​Q​​G​​A​571  ​T​​A​​A​​T​​G​​S​​E​​E​​K​​F​581  ​D​​G​​R​​L​​E​​D​​A​​Y​​A​​E​591  ​K​​V​​K​​N​​R​​S​​P​​D​​M​​S​601  ​D​​G​​S​​D​​F​​E​​D​​I​​N​​T​611  ​T​​T​​G​​T​​D​​L​​D​​T​​T​​T​621  ​G​​T​​G​​S​​D​​L​​D​​S​​D​​L​631  ​D​​S​​D​​R​​D​​K​​G​​K​​D​​K​641  ​G​​K​​P​​V​​E​​S​​K​​P​​E​​F​651  ​G​​G​​A​​S​​V​​P​​P​​G​​A​​M​661  ​N​​S​​V​​A​​E​​V​​P​​A​​F​​Y​671  ​S​​Q​​H​​S​​F​​F​​P​​P​​P​​E​681  ​E​​Q​​L​​L​​T​​A​​S​​G​​A​​A​691  ​G​​D​​S​​I​​K​​A​​I​​A​​S​​I​701  ​A​​E​​K​​Y​​F​​G​​P​​G​​F​​M​711  ​S​​M​​Q​​E​​K​​K​​L​​G​​S​​L​721  ​P​​Y​​H​​S​​V​​F​​P​​F​​Q​​F​731  ​L​​P​​N​​F​​P​​H​​S​​L​​Y​​P​741  ​F​​T​​D​​R​​A​​L​​A​​H​​N​​L​751  ​L​​V​​K​​A​​E​​P​​K​​S​​P​​R​761  ​D​​A​​L​​K​​V​​G​​G​​P​​S​​A​771  ​E​​C​​P​​F​​D​​L​​T​​T​​K​​P​781  ​K​​E​​A​​K​​P​​A​​L​​L​​A​​P​791  ​K​​V​​P​​L​​I​​P​​S​​S​​G​​E​801  ​E​​Q​​P​​L​​D​​L​​S​​I​​G​​S​811  ​R​​A​​R​​A​​S​​Q​​N​​G​​G​​G​821  ​R​​E​​P​​R​​K​​N​​H​​V​​Y​​G​831  ​E​​R​​K​​P​​G​​V​​S​​E​​G​​L​841  ​P​​K​​V​​C​​P​​A​​Q​​L​​P​​Q​851  ​Q​​P​​S​​L​​H​​Y​​A​​K​​P​​S​861  ​P​​F​​F​​M​​D​​P​​I​​Y​​R​​V​871  ​E​​K​​R​​K​​V​​A​​D​​P​​V​​G​881  ​V​​L​​K​​E​​K​​Y​​L​​R​​P​​S​891  ​P​​L​​L​​F​​H​​P​​Q​​M​​S​​A​901  ​I​​E​​T​​M​​T​​E​​K​​L​​E​​S​911  ​F​​A​​A​​M​​K​​A​​D​​S​​G​​S​921  ​S​​L​​Q​​P​​L​​P​​H​​H​​P​​F​931  ​N​​F​​R​​S​​P​​P​​P​​T​​L​​S​941  ​D​​P​​I​​L​​R​​K​​G​​K​​E​​R​951  ​Y​​T​​C​​R​​Y​​C​​G​​K​​I​​F​961  ​P​​R​​S​​A​​N​​L​​T​​R​​H​​L​971  ​R​​T​​H​​T​​G​​E​​Q​​P​​Y​​R​981  ​C​​K​​Y​​C​​D​​R​​S​​F​​S​​I​991  ​S​​S​​N​​L​​Q​​R​​H​​V​​R​​N​1001 ​I​​H​​N​​K​​E​​K​​P​​F​​K​​C​1011 ​H​​L​​C​​N​​R​​C​​F​​G​​Q​​Q​1021 ​T​​N​​L​​D​​R​​H​​L​​K​​K​​H​1031 ​E​​H​​E​​G​​A​​P​​V​​S​​Q​​H​1041 ​S​​G​​V​​L​​T​​N​​H​​L​​G​​T​1051 ​S​​A​​S​​S​​P​​T​​S​​E​​S​​D​1061 ​N​​H​​A​​L​​L​​D​​E​​K​​E​​D​1071 ​S​​Y​​F​​S​​E​​I​​R​​N​​F​​I​1081 ​A​​N​​S​​E​​M​​N​​Q​​A​​S​​T​1091 ​R​​M​​D​​K​​R​​P​​E​​I​​Q​​D​1101 ​L​​D​​S​​N​​P​​P​​C​​P​​G​​S​1111 ​A​​S​​A​​K​​P​​E​​D​​V​​E​​E​1121 ​E​​E​​E​​E​​E​​L​​E​​E​​E​​D​1131 ​D​​D​​S​​L​​A​​G​​K​​S​​Q​​E​1141 ​D​​T​​V​​S​​P​​T​​P​​E​​P​​Q​1151 ​G​​V​​Y​​E​​D​​E​​E​​D​​E​​E​1161 ​P​​P​​S​​L​​T​​M​​G​​F​​D​​H​1171 ​T​​R​​R​​C​​V​​E​​E​​R​​G​​G​1181 ​G​​L​​L​​A​​L​​E​​P​​T​​P​​T​1191 ​F​​G​​K​​G​​L​​D​​L​​R​​R​​A​1201 ​A​​E​​E​​A​​F​​E​​V​​K​​D​​V​1211 ​L​​N​​S​​T​​L​​D​​S​​E​​V​​L​1221 ​K​​Q​​T​​L​​Y​​R​​Q​​A​​K​​N​1231 ​Q​​A​​Y​​A​​M​​M​​L​​S​​L​​S​1241 ​E​​D​​T​​P​​L​​H​​A​​P​​S​​Q​1251 ​S​​S​​L​​D​​A​​W​​L​​N​​I​​T​1261 ​G​​P​​S​​S​​E​​S​​G​​A​​F​​N​1271 ​P​​I​​N​​H​​L​
Type

Model Confidence 
  •   Very high (pLDDT > 90)    
  •   Confident (70 < pLDDT ≤ 90)    
  •   Low (50 < pLDDT ≤ 70)    
  •   Very low (pLDDT ≤ 50)    

Computed Structure Models provide per-residue confidence score (pLDDT) between 0 and 100. Some regions below 50 pLDDT may be unstructured in isolation.

Citation:

See Citation Policies for referencing Mol*, RCSB PDB, PDB structures, and Computed Structure Models.