AF_AFB4HEM4F1

Computed structure model of cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase

Refer to the legend below to interpret the coloring by pLDDT confidence scores.

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RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Sequence of
1    ​M​​T​​D​​V​​S​​S​​P​​A​​G​​G​11   ​A​​A​​S​​P​​V​​E​​M​​T​​T​​S​21   ​S​​S​​P​​A​​A​​T​​T​​S​​A​​S​31   ​S​​S​​K​​P​​L​​T​​N​​G​​A​​N​41   ​K​​T​​T​​I​​S​​T​​T​​A​​G​​G​51   ​V​​A​​P​​G​​D​​V​​P​​G​​T​​G​61   ​S​​G​​A​​I​​P​​A​​S​​S​​S​​S​71   ​G​​N​​Q​​V​​K​​L​​E​​H​​H​​H​81   ​R​​Q​​S​​N​​N​​N​​R​​P​​A​​A​91   ​T​​N​​R​​S​​S​​E​​T​​K​​L​​R​101  ​S​​P​​A​​G​​E​​S​​D​​G​​A​​S​111  ​R​​L​​M​​T​​P​​A​​G​​S​​S​​S​121  ​S​​P​​S​​Q​​S​​P​​S​​Q​​T​​Q​131  ​A​​S​​I​​Q​​T​​Q​​T​​S​​Q​​Q​141  ​D​​R​​L​​T​​K​​A​​S​​T​​T​​A​151  ​S​​Q​​Q​​D​​V​​D​​E​​V​​A​​R​161  ​L​​F​​E​​E​​K​​P​​E​​A​​F​​E​171  ​K​​W​​L​​T​​E​​R​​A​​P​​P​​E​181  ​A​​L​​S​​R​​L​​Q​​E​​F​​I​​E​191  ​N​​R​​K​​P​​H​​K​​R​​P​​S​​V​201  ​T​​S​​D​​L​​F​​Q​​Q​​W​​M​​A​211  ​A​​S​​P​​T​​V​​Q​​Q​​K​​S​​P​221  ​R​​S​​L​​S​​N​​S​​S​​A​​S​​S​231  ​L​​P​​E​​C​​R​​R​​H​​L​​M​​D​241  ​L​​D​​E​​G​​E​​L​​F​​M​​E​​L​251  ​I​​R​​D​​V​​A​​N​​E​​L​​D​​I​261  ​D​​V​​L​​C​​H​​K​​I​​L​​V​​N​271  ​V​​G​​L​​L​​T​​H​​A​​D​​R​​G​281  ​S​​L​​F​​L​​A​​K​​G​​T​​P​​T​291  ​N​​K​​Y​​L​​V​​A​​K​​L​​F​​D​301  ​V​​T​​Q​​K​​T​​A​​L​​K​​D​​A​311  ​V​​A​​R​​A​​S​​A​​E​​E​​I​​I​321  ​I​​P​​F​​G​​I​​G​​I​​A​​G​​M​331  ​V​​A​​Q​​T​​K​​Q​​M​​I​​N​​I​341  ​K​​E​​A​​Y​​K​​D​​A​​R​​F​​N​351  ​C​​E​​I​​D​​L​​K​​T​​G​​Y​​K​361  ​T​​N​​A​​I​​L​​C​​M​​P​​I​​C​371  ​N​​Y​​E​​G​​D​​I​​I​​G​​V​​A​381  ​Q​​I​​I​​N​​K​​T​​N​​G​​C​​M​391  ​E​​F​​D​​E​​H​​D​​V​​E​​I​​F​401  ​R​​R​​Y​​L​​T​​F​​C​​G​​I​​G​411  ​I​​Q​​N​​A​​Q​​L​​F​​E​​M​​S​421  ​V​​Q​​E​​Y​​R​​R​​N​​Q​​I​​L​431  ​L​​N​​L​​A​​R​​S​​I​​F​​E​​E​441  ​Q​​N​​N​​L​​E​​C​​L​​V​​T​​K​451  ​I​​M​​T​​E​​A​​R​​E​​L​​L​​K​461  ​C​​E​​R​​C​​S​​V​​F​​L​​V​​D​471  ​L​​D​​C​​C​​E​​A​​S​​H​​L​​E​481  ​K​​I​​I​​E​​K​​P​​N​​Q​​P​​A​491  ​T​​R​​A​​I​​K​​S​​A​​D​​S​​F​501  ​E​​E​​K​​K​​M​​R​​N​​R​​F​​T​511  ​V​​L​​F​​E​​L​​G​​G​​E​​Y​​Q​521  ​A​​A​​N​​V​​S​​R​​P​​S​​V​​S​531  ​E​​L​​S​​S​​S​​T​​L​​A​​Q​​I​541  ​A​​Q​​F​​V​​A​​T​​T​​G​​Q​​T​551  ​V​​N​​I​​C​​D​​V​​I​​E​​W​​V​561  ​R​​D​​H​​N​​Q​​I​​R​​A​​E​​D​571  ​E​​I​​D​​S​​T​​Q​​A​​I​​L​​C​581  ​M​​P​​I​​M​​N​​A​​Q​​K​​K​​V​591  ​I​​G​​V​​A​​Q​​L​​I​​N​​K​​A​601  ​N​​G​​V​​P​​F​​T​​D​​S​​D​​A​611  ​S​​I​​F​​E​​A​​F​​A​​I​​F​​C​621  ​G​​L​​G​​I​​H​​N​​T​​Q​​M​​Y​631  ​E​​N​​A​​C​​K​​L​​M​​A​​K​​Q​641  ​K​​V​​A​​L​​E​​C​​L​​S​​Y​​H​651  ​A​​T​​A​​S​​Q​​D​​Q​​T​​E​​K​661  ​L​​T​​Q​​D​​V​​I​​A​​E​​A​​E​671  ​S​​Y​​N​​L​​Y​​S​​F​​T​​F​​T​681  ​D​​F​​E​​L​​V​​D​​D​​D​​T​​C​691  ​R​​A​​V​​L​​R​​M​​F​​M​​Q​​C​701  ​N​​L​​V​​S​​Q​​F​​Q​​I​​P​​Y​711  ​D​​V​​L​​C​​R​​W​​V​​L​​S​​V​721  ​R​​K​​N​​Y​​R​​P​​V​​K​​Y​​H​731  ​N​​W​​R​​H​​A​​L​​N​​V​​A​​Q​741  ​T​​M​​F​​A​​M​​L​​K​​T​​G​​K​751  ​M​​E​​R​​F​​M​​T​​D​​L​​E​​I​761  ​L​​G​​L​​L​​V​​A​​C​​L​​C​​H​771  ​D​​L​​D​​H​​R​​G​​T​​N​​N​​A​781  ​F​​Q​​T​​K​​T​​E​​S​​P​​L​​A​791  ​I​​L​​Y​​T​​T​​S​​T​​M​​E​​H​801  ​H​​H​​F​​D​​Q​​C​​V​​M​​I​​L​811  ​N​​S​​E​​G​​N​​N​​I​​F​​Q​​T​821  ​G​​F​​A​​G​​L​​G​​A​​G​​T​​F​831  ​G​​S​​G​​R​​G​​T​​G​​G​​G​​S​841  ​N​​S​​N​​F​​P​​G​​D​​R​​V​​L​851  ​Q​​I​​A​​R​​R​​T​​I​​F​​F​​F​861  ​V​​P​​E​​L​​D​​A​​E​​D​​D​​V​871  ​V​​D​​S​​V​​V​​D​​S​​V​​V​​E​881  ​L​​S​​V​​V​​V​​L​​V​​L​​D​​S​891  ​V​​L​​V​​A​​A​​L​​S​​P​​E​​D​901  ​Y​​R​​S​​V​​M​​K​​T​​V​​E​​S​911  ​A​​I​​L​​S​​T​​D​​L​​A​​M​​Y​921  ​F​​K​​K​​R​​N​​A​​F​​L​​E​​L​931  ​V​​E​​N​​G​​E​​F​​D​​W​​Q​​G​941  ​E​​E​​K​​K​​D​​L​​L​​C​​G​​M​951  ​M​​M​​T​​A​​C​​D​​V​​S​​A​​I​961  ​A​​K​​P​​W​​E​​V​​Q​​H​​K​​V​971  ​A​​K​​L​​V​​A​​D​​E​​F​​F​​D​981  ​Q​​G​​D​​L​​E​​K​​L​​Q​​L​​N​991  ​T​​Q​​P​​V​​A​​M​​M​​D​​R​​E​1001 ​R​​K​​D​​E​​L​​P​​K​​M​​Q​​V​1011 ​G​​F​​I​​D​​V​​I​​C​​L​​P​​L​1021 ​Y​​R​​V​​L​​C​​D​​T​​F​​P​​W​1031 ​I​​T​​P​​L​​Y​​E​​G​​T​​L​​E​1041 ​N​​R​​R​​N​​W​​Q​​D​​L​​A​​E​1051 ​K​​V​​E​​M​​G​​L​​T​​W​​I​​D​1061 ​H​​D​​T​​I​​D​​K​​P​​V​​E​​E​1071 ​F​​A​​A​​C​​A​​D​​E​​E​​I​​K​1081 ​D​​I​​E​​F​​T​​V​​T​​T​​L​​N​1091 ​C​​N​​Q​​Q​​S​​Q​​H​​G​​S​​E​1101 ​D​​S​​H​​T​​P​​E​​H​​Q​​R​​S​1111 ​G​​S​​R​​L​​S​​M​​K​​K​​T​​G​1121 ​A​​L​​G​​K​​A​​V​​R​​S​​K​​L​1131 ​S​​K​​T​​L​​Y​​N​​S​​M​​D​​G​1141 ​S​​K​​P​​K​​T​​S​​L​​K​​L​​L​1151 ​E​​S​​H​​V​​S​​E​​D​​M​​D​​D​1161 ​K​​S​​P​​T​​S​​P​​S​​Q​​P​​Q​1171 ​A​​S​​G​​S​​M​​G​​R​​M​​S​​A​1181 ​S​​S​​S​​T​​S​​S​​A​​G​​G​​Q​1191 ​M​​V​​D​​K​​S​​K​​K​​R​​S​​K​1201 ​L​​C​​A​​L​​L​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

Model Confidence 
  •   Very high (pLDDT > 90)    
  •   Confident (70 < pLDDT ≤ 90)    
  •   Low (50 < pLDDT ≤ 70)    
  •   Very low (pLDDT ≤ 50)    

Computed Structure Models provide per-residue confidence score (pLDDT) between 0 and 100. Some regions below 50 pLDDT may be unstructured in isolation.

Citation:

See Citation Policies for referencing Mol*, RCSB PDB, PDB structures, and Computed Structure Models.