Structure Determination Methodology Scientific Name of Source Organism More...
Refinement Resolution (Å) Enzyme Classification Name Membrane Protein Annotation -- Tabular Report -- Entry IDs Create Custom Report Structure Sequence Ligand Oligosaccharide Structural Genomics Center Primary Citation Biological Details Sequence Clusters Binding Affinity Crystallization Data Collection Refinement Refinement Parameters Unit Cell NMR Representative Model NMR Spectrometer NMR Sample Conditions NMR Refinement NMR Ensemble NMR Software EM Structure
Hirata, K. , Shinzawa-Itoh, K. , Yano, N. , Takemura, S. , Kato, K. , Hatanaka, M. , Muramoto, K. , Kawahara, T. , Tsukihara, T. , Yamashita, E. , Tono, K. , Ueno, G. , Hikima, T. , Murakami, H. , Inubushi, Y. , Yabashi, M. , Ishikawa, T. , Yamamoto, M. , Ogura, T. , Sugimoto, H. , Shen, J.R. , Yoshikawa, S. , Ago, H.
(2014) Nat Methods 11 : 734-736
Released 2014-04-30 Method X-RAY DIFFRACTION 1.9 Å
Organisms Macromolecule Unique protein chains: 13
Unique Ligands CDL , CHD , CU , CUA , DMU , HEA , MG , NA , PEK , PER , PGV , PSC , TGL , ZN
Mizohata, E. , Suzuki, M. , Kakinouchi, K. , Sugiyama, S. , Murata, M. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tanaka, T. , Tanaka, R. , Tono, K. , Song, C. , Hatsui, T. , Joti, Y. , Yabashi, M. , Iwata, S.
(2015) Nat Methods 12 : 61-63
Released 2014-11-05 Method X-RAY DIFFRACTION 1.6 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands STE
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.43 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , NA
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-09 Method X-RAY DIFFRACTION 2.03 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CL , CU
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.35 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands ACY , CU
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-09 Method X-RAY DIFFRACTION 1.2 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands ACY , CU , MPD
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.5 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diedrichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.34 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.5 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.34 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diedrichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.5 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.34 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Suzuki, M. , Diederichs, K. , Hirata, K. , Nakane, T. , Sugahara, M. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Matsumura, H. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) J Biochem 159 : 527-538
Released 2016-02-24 Method X-RAY DIFFRACTION 1.5 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , MPD , SO4
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Nakane, T. , Nakatsu, T. , Suzuki, M. , Sugahara, M. , Inoue, S. , Masuda, T. , Yumoto, F. , Matsugaki, N. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Murphy, M.E.P. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-09 Method X-RAY DIFFRACTION 1.3 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands ACY , CU , GOL , NO2
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Nakane, T. , Nakatsu, T. , Suzuki, M. , Sugahara, M. , Inoue, S. , Masuda, T. , Yumoto, F. , Matsugaki, N. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Murphy, M.E.P. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-09 Method X-RAY DIFFRACTION 1.6 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , NO2
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Nakane, T. , Nakatsu, T. , Suzuki, M. , Sugahara, M. , Inoue, S. , Yumoto, F. , Matsugaki, N. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Murphy, M.E.P. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-09 Method X-RAY DIFFRACTION 2 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands ACY , CL , CU , GOL
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Nakane, T. , Nakatsu, T. , Suzuki, M. , Sugahara, M. , Inoue, S. , Masuda, T. , Yumoto, F. , Matsugaki, N. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Murphy, M.E.P. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-16 Method X-RAY DIFFRACTION 1.54 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , NO2
Fukuda, Y. , Tse, K.M. , Nakane, T. , Nakatsu, T. , Suzuki, M. , Sugahara, M. , Inoue, S. , Masuda, T. , Yumoto, F. , Matsugaki, N. , Nango, E. , Tono, K. , Joti, Y. , Kameshima, T. , Song, C. , Hatsui, T. , Yabashi, M. , Nureki, O. , Murphy, M.E.P. , Inoue, T. , Iwata, S. , Mizohata, E.
(2016) Proc Natl Acad Sci U S A 113 : 2928-2933
Released 2016-03-16 Method X-RAY DIFFRACTION 1.56 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU
Andersson, R. , Safari, C. , Dods, R. , Nango, E. , Tanaka, R. , Nakane, T. , Tono, K. , Joti, Y. , Bath, P. , Dunevall, E. , Bosman, E. , Nureki, O. , Iwata, S. , Neutze, R. , Branden, G.
(2017) Sci Rep 7 : 4518-4518
Released 2017-08-23 Method X-RAY DIFFRACTION 2.3 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands CU , CUA , HAS , HEM , OLC
Suno, R. , Kimura, K. , Nakane, T. , Yamashita, K. , Wang, J. , Fujiwara, T. , Yamanaka, Y. , Im, D. , Tsujimoto, H. , Sasanuma, M. , Horita, S. , Hirokawa, T. , Nango, E. , Tono, K. , Kameshima, T. , Hatsui, T. , Joti, Y. , Yabashi, M. , Shimamoto, K. , Yamamoto, M. , Rosenbaum, D.M. , Iwata, S. , Shimamura, T. , Kobayashi, T.
(2018) Structure 26 : 7-19.e5
Released 2017-12-13 Method X-RAY DIFFRACTION 2.3 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands 1PE , 7MA , OLA
Shimada, A. , Kubo, M. , Baba, S. , Yamashita, K. , Hirata, K. , Ueno, G. , Nomura, T. , Kimura, T. , Shinzawa-Itoh, K. , Baba, J. , Hatano, K. , Eto, Y. , Miyamoto, A. , Murakami, H. , Kumasaka, T. , Owada, S. , Tono, K. , Yabashi, M. , Yamaguchi, Y. , Yanagisawa, S. , Sakaguchi, M. , Ogura, T. , Komiya, R. , Yan, J. , Yamashita, E. , Yamamoto, M. , Ago, H. , Yoshikawa, S. , Tsukihara, T.
(2017) Sci Adv 3 : e1603042-e1603042
Released 2017-08-09 Method X-RAY DIFFRACTION 2.2 Å
Organisms Macromolecule Unique protein chains: 13
Unique Ligands CDL , CHD , CMO , CU , CUA , DMU , EDO , HEA , MG , NA , PEK , PGV , PSC , TGL , UNX , ZN
Shimada, A. , Kubo, M. , Baba, S. , Yamashita, K. , Hirata, K. , Ueno, G. , Nomura, T. , Kimura, T. , Shinzawa-Itoh, K. , Baba, J. , Hatano, K. , Eto, Y. , Miyamoto, A. , Murakami, H. , Kumasaka, T. , Owada, S. , Tono, K. , Yabashi, M. , Yamaguchi, Y. , Yanagisawa, S. , Sakaguchi, M. , Ogura, T. , Komiya, R. , Yan, J. , Yamashita, E. , Yamamoto, M. , Ago, H. , Yoshikawa, S. , Tsukihara, T.
(2017) Sci Adv 3 : e1603042-e1603042
Released 2017-08-09 Method X-RAY DIFFRACTION 2.4 Å
Organisms Macromolecule Unique protein chains: 13
Unique Ligands CDL , CHD , CMO , CU , CUA , DMU , EDO , HEA , MG , NA , PEK , PGV , PSC , TGL , UNX , ZN
Shimada, A. , Kubo, M. , Baba, S. , Yamashita, K. , Hirata, K. , Ueno, G. , Nomura, T. , Kimura, T. , Shinzawa-Itoh, K. , Baba, J. , Hatano, K. , Eto, Y. , Miyamoto, A. , Murakami, H. , Kumasaka, T. , Owada, S. , Tono, K. , Yabashi, M. , Yamaguchi, Y. , Yanagisawa, S. , Sakaguchi, M. , Ogura, T. , Komiya, R. , Yan, J. , Yamashita, E. , Yamamoto, M. , Ago, H. , Yoshikawa, S. , Tsukihara, T.
(2017) Sci Adv 3 : e1603042-e1603042
Released 2017-08-09 Method X-RAY DIFFRACTION 2.2 Å
Organisms Macromolecule Unique protein chains: 13
Unique Ligands CDL , CHD , CMO , CU , CUA , DMU , EDO , HEA , MG , NA , PEK , PGV , PSC , TGL , UNX , ZN
Tosha, T. , Nomura, T. , Nishida, T. , Yamagiwa, R. , Yamashita, K. , Hirata, K. , Ueno, G. , Kimura, T. , Hisano, T. , Muramoto, K. , Sawai, H. , Takeda, H. , Yamashita, A. , Murakami, H. , Owada, S. , Tono, K. , Yabashi, M. , Yamamoto, M. , Ago, H. , Sugimoto, H. , Shiro, Y. , Kubo, M.
(2017) Nat Commun 8 : 1585-1585
Released 2017-12-06 Method X-RAY DIFFRACTION 1.5 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands GOL , HEM , NO
Tosha, T. , Nomura, T. , Nishida, T. , Saeki, N. , Okubayashi, K. , Yamagiwa, R. , Sugahara, M. , Nakane, T. , Yamashita, K. , Hirata, K. , Ueno, G. , Kimura, T. , Hisano, T. , Muramoto, K. , Sawai, H. , Takeda, H. , Mizohata, E. , Yamashita, A. , Kanematsu, Y. , Takano, Y. , Nango, E. , Tanaka, R. , Nureki, O. , Ikemoto, Y. , Murakami, H. , Owada, S. , Tono, K. , Yabashi, M. , Yamamoto, M. , Ago, H. , Iwata, S. , Sugimoto, H. , Shiro, Y. , Kubo, M.
(2017) Nat Commun 8 : 1585-1585
Released 2017-12-06 Method X-RAY DIFFRACTION 2.1 Å
Organisms Macromolecule Unique Ligands GOL , HEM , NO