X-RAY DIFFRACTION

Starting Model(s)

Initial Refinement Model(s)
TypeSourceAccession CodeDetails
experimental modelPDB 4FMG 

Crystallization

Crystalization Experiments
IDMethodpHTemperatureDetails
1VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP7.5293HEPES, PEG 8000, ethylene glycol
Crystal Properties
Matthews coefficientSolvent content
2.754.43

Crystal Data

Unit Cell
Length ( Å )Angle ( ˚ )
a = 145.048α = 90
b = 91.614β = 92.1
c = 352.326γ = 90
Symmetry
Space GroupP 1 21 1

Diffraction

Diffraction Experiment
ID #Crystal IDScattering TypeData Collection TemperatureDetectorDetector TypeDetailsCollection DateMonochromatorProtocol
11x-ray93PIXELDECTRIS EIGER X 16M2017-12-06MSINGLE WAVELENGTH
Radiation Source
ID #SourceTypeWavelength ListSynchrotron SiteBeamline
1SYNCHROTRONSLS BEAMLINE X06SA1.00001SLSX06SA

Data Collection

Overall
ID #Resolution (High)Resolution (Low)Percent Possible (Observed)Rrim I (All)CC (Half)Net I Over Average Sigma (I)RedundancyNumber Reflections (All)Number Reflections (Observed)Observed Criterion Sigma (F)Observed Criterion Sigma (I)B (Isotropic) From Wilson Plot
12.61848.0798.450.2620.9936.113.927470755.5
Highest Resolution Shell
ID #Resolution (High)Resolution (Low)Percent Possible (All)Percent Possible (Observed)Rrim I (All)CC (Half)Mean I Over Sigma (Observed)RedundancyNumber Unique Reflections (All)
12.6182.770.1560.6421.03

Refinement

Statistics
Diffraction IDStructure Solution MethodCross Validation methodStarting modelResolution (High)Resolution (Low)Number Reflections (Observed)Number Reflections (R-Free)Percent Reflections (Observed)R-Factor (All)R-WorkR-FreeMean Isotropic B
X-RAY DIFFRACTIONMOLECULAR REPLACEMENTFREE R-VALUE4FMG2.61848.068274706274898.5340.270.26980.300350.781
Temperature Factor Modeling
Anisotropic B[1][1]Anisotropic B[1][2]Anisotropic B[1][3]Anisotropic B[2][2]Anisotropic B[2][3]Anisotropic B[3][3]
-3.7373.6776.363-2.887
RMS Deviations
KeyRefinement Restraint Deviation
r_dihedral_angle_2_deg36.754
r_dihedral_angle_3_deg15.229
r_dihedral_angle_4_deg14.496
r_lrange_it8.473
r_lrange_other8.472
r_dihedral_angle_1_deg7.14
r_mcangle_it5.07
r_mcangle_other5.07
r_scangle_it4.425
r_scangle_other4.425
RMS Deviations
KeyRefinement Restraint Deviation
r_dihedral_angle_2_deg36.754
r_dihedral_angle_3_deg15.229
r_dihedral_angle_4_deg14.496
r_lrange_it8.473
r_lrange_other8.472
r_dihedral_angle_1_deg7.14
r_mcangle_it5.07
r_mcangle_other5.07
r_scangle_it4.425
r_scangle_other4.425
r_mcbond_it3.217
r_mcbond_other3.217
r_scbond_it2.757
r_scbond_other2.757
r_angle_other_deg2.449
r_angle_refined_deg1.373
r_nbd_other0.373
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r_symmetry_xyhbond_nbd_refined0.245
r_symmetry_nbd_other0.224
r_nbd_refined0.195
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r_symmetry_xyhbond_nbd_other0.131
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Software

Software
Software NamePurpose
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XDSdata scaling
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